CIC biomaGUNE Biomaterialen Ikerketa Kooperatiboko Zentroak epiGPTope garatu du (Multiverse Computing enpresarekin lankidetzan), ikaskuntza automatikoan oinarritutako epipoak sortzen eta sailkatzen dituen sistema.
Organismoan birusak edo bakterioak egoteak immunitate-sistema aktibatzen du. Sortzen diren antigorputzek birus edo bakterio horien zati txiki bat ezagutzen dute, epipoak, eta eraso-estrategia bat martxan jartzen dute. Epilopo horiek antigorputz bidez edo zelula immunitarioen hartzaileek aitortutako proteina zati txikiak dira. Beraz, antigorputz espezifikoetara bideratzen diren epipoen sekuentzia berriak aurkitzea funtsezkoa da diagnostikorako tresnak, immunoterpiak eta txertoak garatzeko.
CIC biomaGUNEko Nanoteknologia Biomolekularreko laborategia, Aitziber L. Cortajarena Ikerbasque irakaslea buru duena, ehunka mila epilopo sintetikoren liburu-denda edo datu-base bat sortzen ari da adimen artifizialean oinarritutako teknika honen laguntzarekin. Biologikoki bideragarriak diren sekuentziak sortzeko metodo horrek aukera ematen dio ikerketa-taldeari epilopo sintetikoak azkarrago eta errentagarriago sortzeko eta hautatzeko, bai eta jatorri biralaren edo bakterianoaren arabera sailkatzeko ere, bioteknologian eta biomedikuntzan aplikatzea erraztuz.
“Milioika konbinazio posibleren artean, epiopo sintetikoak detektatzen ditugu, epiopo naturalen oso antzekoak, antigorputzek ezagut ditzaketenak — azaldu du Aitor Manteca taldeko ikertzaile elkartuak —, ikusteko zer aplikazio izan ditzaketen molekula horiek ikerketa medikoan, farmakoen garapenean edo bioteknologian. Gainera, epitopo bat bakterio edo birus batena den bereizteko gai gara “. Horrela, “ehunka mila unitateko (ehunka milioiren ordez) epipoen liburutegi arrazional bat eraikitzea lortzen dute, laborategian gordetzen direnak. Esperimentaziorako molekulen bilduma fisikoak dira “, gehitu du.
Hala ere, epilopo horiek ez dira laborategiko hodi txikietan geratzen. Benetako aplikazioak bilatzen zaizkie. Lehen baheketa hori egin ondoren, proteina zatiak mikrofluidikoko sistemen bidez aztertzen dira. Teknologia horri esker, “antigorputz jakin baten aurka epiptopo bakarra probatzen da, oso modu zehatz, azkar eta merkean, eta emaitza asko lortzen dira denbora gutxian”, azaldu du Mantecak. Mikrofluidikoari esker, esperimentuak oso tanta txikietan egiten dira, eta horiek erreaktore bakar gisa funtzionatzen dute, molekula kopuru oso txikiekin. “Posible da aldi berean milioika konbinazio desberdin aztertzea denbora laburrean”, gehitu du CIC biomaGUNEko ikertzaileak.
Erantzun inmunitarioaren bila
Hala, aldez aurretik jakin daiteke “zer sekuentziek sortuko dituzten erantzun immunitarioak, eta aurrera egin daiteke, adibidez, diagnostiko-teknikak eta organismo batean, odolean, uretan eta abarretan bakterio edo birus baten presentzia neurtzeko gai diren Point of Care gailu berriak sortzen. “, azaldu du Aitor Manteca medikuak.
Garapen horiek bereziki garrantzitsuak dira industria-ingurunera transferitzeko, Taldeki Biosolutions enpresaren kasuan bezala, CIC biomaGUNEk lizentziatutako detekzio-teknologia ustiatzen baitu. Testuinguru horretan, epipoak azkar eta modu arrazionalean sortzeko eta hautatzeko gaitasunari esker, modu esanguratsuan bizkortu daiteke ezagutza-elementuen identifikazioa eta baliozkotzea, sentsore berrietan integratzeko.
Epipoen garapena
Espero da hurbilketa horrek eragin zuzena izatea konponbide diagnostiko aurreratuen garapenean; izan ere, epipoen garapen eta hautaketa azkarrari esker, sentsore-teknologia horien irismena nabarmen hedatuko da detekzio-aplikazio askotara. Eremu biomedikoa ez ezik, ingurumen- eta bioteknologia-inguruneak ere barne hartzen ditu, funtsezko ikerketaren eta industria-aplikazioaren arteko lotura indartuz.
Ikaskuntza automatikoko eta adimen artifizialeko algoritmoen erabilera aplikatzen diren eremu guztiak iraultzen ari da. Bioteknologia ez da salbuespena, eta esan liteke bioinformatika dela garatzen ari diren teknologia berri asko hartzen lehenetarikoa.